Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC1A4P43007 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A4P43007 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC1A4P43007 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms