Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA2P42262 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms