Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTR1BP42025 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR1BP42025 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms