Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC26A3P40879 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC26A3P40879 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC26A3P40879 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms