Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP8P40818 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP8P40818 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP8P40818 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP8P40818 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP8P40818 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP8P40818 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP8P40818 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP8P40818 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP8P40818 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP8P40818 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP8P40818 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP8P40818 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP8P40818 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP8P40818 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP8P40818 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP8P40818 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP8P40818 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP8P40818 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP8P40818 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP8P40818 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP8P40818 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP8P40818 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP8P40818 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP8P40818 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP8P40818 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP8P40818 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP8P40818 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP8P40818 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP8P40818 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP8P40818 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP8P40818 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP8P40818 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP8P40818 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP8P40818 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP8P40818 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP8P40818 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP8P40818 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP8P40818 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP8P40818 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP8P40818 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP8P40818 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP8P40818 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP8P40818 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms