Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YFL068WYFL068W 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YKL151CYKL151C 1014 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 TAF11YML015C 1041 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YMR085WYMR085W 1299 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RMI1YPL024W 726 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 ISR1YPR106W 1332 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 JEM1YJL073W 1938 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YER158CYER158C 1722 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RFT1YBL020W 1725 nt4.38□□□□□ -1.71
DDI1P40087 TPO2YGR138C 1845 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RAM1YDL090C 1296 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 TRM8YDL201W 861 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 UBC6YER100W 753 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 MRPL13YKR006C 795 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 IMP2YMR035W 534 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 ROT1YMR200W 771 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 TOM7YNL070W 183 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 snR3snR3 194 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 SUP35YDR172W 2058 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 AKL1YBR059C 3327 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 SMP1YBR182C 1359 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 MMR1YLR190W 1476 nt4.37□□□□□ -1.71
DDI1P40087 OLE1YGL055W 1533 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 GSY1YFR015C 2127 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 MKS1YNL076W 1755 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 CNL1YDR357C 369 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 PRO3YER023W 861 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 EFM4YIL064W 774 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 HPM1YIL110W 1134 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YKL169CYKL169C 384 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YLR118CYLR118C 684 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RPN5YDL147W 1338 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 PEP5YMR231W 3090 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 LAP2YNL045W 2016 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RAD28YDR030C 1521 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RRP3YHR065C 1506 nt4.36□□□□□ -1.71
DDI1P40087 SEN1YLR430W 6696 nt4.35□□□□□ -1.71
DDI1P40087 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt4.35□□□□□ -1.71
DDI1P40087 NAT2YGR147C 867 nt4.35□□□□□ -1.71
DDI1P40087 EAR1YMR171C 1653 nt4.35□□□□□ -1.71
DDI1P40087 IFM1YOL023W 2031 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 PRM7YDL039C 2097 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 MAD2YJL030W 591 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 TVP38YKR088C 1014 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 TDA5YLR426W 981 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 CUE5YOR042W 1236 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 RRB1YMR131C 1536 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 ALD3YMR169C 1521 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 ALD2YMR170C 1521 nt4.34□□□□□ -1.71
DDI1P40087 PMT5YDL093W 2232 nt4.34□□□□□ -1.72
DDI1P40087 LEU1YGL009C 2340 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 IMA3YIL172C 1770 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 IMA4YJL221C 1770 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YHR177WYHR177W 1362 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 FMP48YGR052W 1110 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 DAL3YIR032C 588 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YOR318CYOR318C 306 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 CDC48YDL126C 2508 nt4.33□□□□□ -1.72
DDI1P40087 CAB3YKL088W 1716 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 VAC7YNL054W 3498 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 WTM1YOR230W 1314 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 GET3YDL100C 1065 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 CYM1YDR430C 2970 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 FAU1YER183C 636 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 PUS6YGR169C 1215 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YGR291CYGR291C 222 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 GPI12YMR281W 915 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 RCK2YLR248W 1833 nt4.32□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YBR139WYBR139W 1527 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 HRR25YPL204W 1485 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 GSM1YJL103C 1857 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 CUZ1YNL155W 825 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YOL035CYOL035C 303 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 IXR1YKL032C 1794 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 PRD1YCL057W 2139 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 TRS85YDR108W 2097 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 MET4YNL103W 2019 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 YJR015WYJR015W 1533 nt4.31□□□□□ -1.72
DDI1P40087 GSH2YOL049W 1476 nt4.3□□□□□ -1.72
DDI1P40087 RAD30YDR419W 1899 nt4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.5 ms