Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJC1P36383 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJC1P36383 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJC1P36383 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJC1P36383 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJC1P36383 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJC1P36383 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJC1P36383 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJC1P36383 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJC1P36383 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJC1P36383 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJC1P36383 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GJC1P36383 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJC1P36383 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJC1P36383 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJC1P36383 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJC1P36383 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJC1P36383 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJC1P36383 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJC1P36383 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJC1P36383 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJC1P36383 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJC1P36383 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJC1P36383 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJC1P36383 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJC1P36383 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJC1P36383 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJC1P36383 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJC1P36383 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJC1P36383 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJC1P36383 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJC1P36383 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJC1P36383 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJC1P36383 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms