Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYLC1P35663 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYLC1P35663 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYLC1P35663 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms