Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCGF2P35227 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF2P35227 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms