Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTNNB1P35222 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTNNB1P35222 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTNNB1P35222 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms