Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMPK1P30085 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMPK1P30085 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms