Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBL1P28749 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBL1P28749 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBL1P28749 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBL1P28749 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBL1P28749 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBL1P28749 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBL1P28749 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RBL1P28749 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL1P28749 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL1P28749 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL1P28749 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL1P28749 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms