Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDE4AP27815 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE4AP27815 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms