Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VARSP26640 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARSP26640 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARSP26640 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARSP26640 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARSP26640 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARSP26640 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARSP26640 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARSP26640 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VARSP26640 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VARSP26640 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VARSP26640 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VARSP26640 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VARSP26640 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VARSP26640 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VARSP26640 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VARSP26640 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VARSP26640 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VARSP26640 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VARSP26640 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VARSP26640 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VARSP26640 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VARSP26640 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VARSP26640 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VARSP26640 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VARSP26640 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VARSP26640 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VARSP26640 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VARSP26640 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VARSP26640 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VARSP26640 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VARSP26640 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VARSP26640 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VARSP26640 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VARSP26640 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms