Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCNE1P24864 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNE1P24864 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNE1P24864 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms