Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDELR1P24390 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDELR1P24390 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDELR1P24390 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms