Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2B4P23634 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP2B4P23634 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2B4P23634 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms