Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPREP23469 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPREP23469 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPREP23469 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPREP23469 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPREP23469 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPREP23469 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPREP23469 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPREP23469 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPREP23469 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPREP23469 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPREP23469 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPREP23469 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPREP23469 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPREP23469 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPREP23469 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPREP23469 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPREP23469 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPREP23469 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPREP23469 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPREP23469 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPREP23469 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPREP23469 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPREP23469 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPREP23469 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPREP23469 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPREP23469 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPREP23469 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPREP23469 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPREP23469 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPREP23469 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PTPREP23469 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPREP23469 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPREP23469 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPREP23469 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPREP23469 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPREP23469 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPREP23469 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPREP23469 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPREP23469 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPREP23469 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPREP23469 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPREP23469 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPREP23469 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPREP23469 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPREP23469 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPREP23469 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPREP23469 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms