Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TUBG1P23258 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBG1P23258 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms