Protein–RNA interactions for Protein: P21926

CD9, CD9 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD9P21926 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD9P21926 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD9P21926 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD9P21926 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD9P21926 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD9P21926 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD9P21926 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD9P21926 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD9P21926 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD9P21926 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD9P21926 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD9P21926 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD9P21926 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD9P21926 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD9P21926 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD9P21926 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD9P21926 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD9P21926 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD9P21926 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD9P21926 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms