Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BGNP21810 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BGNP21810 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BGNP21810 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BGNP21810 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BGNP21810 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BGNP21810 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BGNP21810 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BGNP21810 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BGNP21810 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BGNP21810 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BGNP21810 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BGNP21810 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BGNP21810 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BGNP21810 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BGNP21810 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BGNP21810 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BGNP21810 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BGNP21810 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BGNP21810 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BGNP21810 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BGNP21810 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BGNP21810 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BGNP21810 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BGNP21810 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BGNP21810 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BGNP21810 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BGNP21810 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BGNP21810 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BGNP21810 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BGNP21810 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BGNP21810 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BGNP21810 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BGNP21810 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BGNP21810 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BGNP21810 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BGNP21810 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BGNP21810 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BGNP21810 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BGNP21810 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BGNP21810 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BGNP21810 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms