Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNB1P20700 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms