Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFKB1P19838 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NFKB1P19838 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NFKB1P19838 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms