Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ERCC3P19447 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERCC3P19447 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms