Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2EP19388 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2EP19388 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2EP19388 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms