Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH2P19022 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH2P19022 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH2P19022 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH2P19022 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH2P19022 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH2P19022 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH2P19022 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDH2P19022 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH2P19022 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH2P19022 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH2P19022 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDH2P19022 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH2P19022 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH2P19022 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH2P19022 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH2P19022 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH2P19022 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH2P19022 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH2P19022 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDH2P19022 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDH2P19022 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH2P19022 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH2P19022 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH2P19022 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH2P19022 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH2P19022 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH2P19022 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH2P19022 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH2P19022 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH2P19022 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH2P19022 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH2P19022 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH2P19022 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH2P19022 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH2P19022 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH2P19022 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH2P19022 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms