Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB6P18564 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGB6P18564 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGB6P18564 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms