Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPN1P18031 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN1P18031 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms