Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA3P15088 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPA3P15088 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPA3P15088 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA3P15088 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA3P15088 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA3P15088 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPA3P15088 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA3P15088 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA3P15088 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA3P15088 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA3P15088 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPA3P15088 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA3P15088 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA3P15088 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA3P15088 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA3P15088 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA3P15088 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPA3P15088 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA3P15088 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA3P15088 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA3P15088 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA3P15088 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA3P15088 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA3P15088 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA3P15088 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPA3P15088 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPA3P15088 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPA3P15088 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPA3P15088 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPA3P15088 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA3P15088 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA3P15088 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA3P15088 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA3P15088 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA3P15088 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPA3P15088 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPA3P15088 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPA3P15088 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA3P15088 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA3P15088 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA3P15088 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA3P15088 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA3P15088 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPA3P15088 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA3P15088 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPA3P15088 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms