Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM27P14373 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM27P14373 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms