Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKAR2AP13861 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKAR2AP13861 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms