Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP1A3P13637 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP1A3P13637 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms