Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFHP12036 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFHP12036 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFHP12036 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFHP12036 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFHP12036 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFHP12036 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFHP12036 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFHP12036 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFHP12036 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFHP12036 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFHP12036 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFHP12036 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFHP12036 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFHP12036 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFHP12036 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFHP12036 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFHP12036 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFHP12036 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFHP12036 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFHP12036 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFHP12036 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFHP12036 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFHP12036 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFHP12036 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFHP12036 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFHP12036 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEFHP12036 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEFHP12036 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEFHP12036 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEFHP12036 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms