Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB1P11230 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB1P11230 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms