Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GZMBP10144 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GZMBP10144 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GZMBP10144 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GZMBP10144 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GZMBP10144 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GZMBP10144 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GZMBP10144 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GZMBP10144 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GZMBP10144 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms