Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAA1P0DJI8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SAA1P0DJI8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms