Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PGA3P0DJD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms