Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC166P0CW27 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC166P0CW27 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms