Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYNP07948 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYNP07948 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYNP07948 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LYNP07948 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LYNP07948 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
LYNP07948 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LYNP07948 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LYNP07948 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYNP07948 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYNP07948 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYNP07948 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYNP07948 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYNP07948 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYNP07948 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LYNP07948 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYNP07948 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYNP07948 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYNP07948 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYNP07948 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYNP07948 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYNP07948 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYNP07948 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYNP07948 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYNP07948 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYNP07948 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYNP07948 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYNP07948 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms