Protein–RNA interactions for Protein: P05231

IL6, Interleukin-6, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6P05231 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IL6P05231 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IL6P05231 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IL6P05231 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IL6P05231 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IL6P05231 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IL6P05231 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6P05231 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6P05231 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6P05231 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6P05231 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6P05231 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6P05231 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6P05231 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IL6P05231 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IL6P05231 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IL6P05231 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IL6P05231 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IL6P05231 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IL6P05231 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms