Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN2P04844 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN2P04844 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPN2P04844 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN2P04844 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN2P04844 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN2P04844 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN2P04844 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN2P04844 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN2P04844 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPN2P04844 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPN2P04844 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPN2P04844 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPN2P04844 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPN2P04844 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPN2P04844 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN2P04844 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN2P04844 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN2P04844 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN2P04844 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPN2P04844 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN2P04844 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN2P04844 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN2P04844 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN2P04844 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN2P04844 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN2P04844 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN2P04844 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPN2P04844 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPN2P04844 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPN2P04844 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPN2P04844 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPN2P04844 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPN2P04844 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPN2P04844 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPN2P04844 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPN2P04844 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPN2P04844 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPN2P04844 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms