Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN1SWP03999 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPN1SWP03999 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN1SWP03999 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN1SWP03999 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN1SWP03999 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN1SWP03999 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN1SWP03999 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPN1SWP03999 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPN1SWP03999 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPN1SWP03999 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms