Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNC2P02585 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNNC2P02585 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms