Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHG4P01861 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IGHG4P01861 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms