Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SERPINA1P01009 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERPINA1P01009 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms