Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHEK2O96017 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHEK2O96017 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms