Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN7O95471 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN7O95471 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLDN7O95471 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms