Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM2O94769 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM2O94769 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM2O94769 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM2O94769 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM2O94769 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM2O94769 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ECM2O94769 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM2O94769 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM2O94769 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM2O94769 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM2O94769 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ECM2O94769 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ECM2O94769 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM2O94769 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM2O94769 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM2O94769 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM2O94769 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM2O94769 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM2O94769 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM2O94769 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ECM2O94769 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ECM2O94769 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ECM2O94769 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ECM2O94769 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM2O94769 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM2O94769 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM2O94769 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM2O94769 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM2O94769 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ECM2O94769 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM2O94769 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM2O94769 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM2O94769 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM2O94769 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM2O94769 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM2O94769 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ECM2O94769 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM2O94769 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM2O94769 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM2O94769 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ECM2O94769 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM2O94769 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM2O94769 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM2O94769 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM2O94769 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ECM2O94769 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM2O94769 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM2O94769 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM2O94769 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM2O94769 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM2O94769 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ECM2O94769 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM2O94769 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM2O94769 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM2O94769 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM2O94769 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM2O94769 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM2O94769 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM2O94769 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ECM2O94769 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM2O94769 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM2O94769 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ECM2O94769 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM2O94769 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM2O94769 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM2O94769 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM2O94769 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ECM2O94769 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ECM2O94769 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms