Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJB3O75712 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB3O75712 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB3O75712 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB3O75712 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB3O75712 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB3O75712 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJB3O75712 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJB3O75712 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJB3O75712 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB3O75712 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB3O75712 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB3O75712 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJB3O75712 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJB3O75712 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB3O75712 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB3O75712 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB3O75712 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB3O75712 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB3O75712 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJB3O75712 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJB3O75712 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJB3O75712 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJB3O75712 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms