Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRCH4O75427 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH4O75427 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms